Nach Kriegen, Naturkatastrophen oder anderen Krisen konzentriert sich Malteser International zunächst darauf, die menschlichen Grundbedürfnisse zu befriedigen. In der Anfangsphase geht es immer darum, das Überleben der Menschen zu sichern. Ein wichtiger Teil der Nothilfe ist die medizinische Soforthilfe sowie die Verteilung von Nahrungsmitteln und sonstigen Hilfsgütern – beispielsweise zur Aufbereitung und sicheren Aufbewahrung von Wasser oder zum Bau von Notunterkünften. 

Sind diese Grundbedürfnisse befriedigt, ist es das Ziel, die Verwundbarkeit der von der Krise oder Katastrophe betroffenen Menschen zu verringern. Hierzu führt Malteser International nachhaltige Wiederaufbauprogramme durch. Diese umfassen zum einen den Wiederaufbau von Häusern und öffentlichen Gebäuden und zum anderen soziale Maßnahmen wie die Wiedereingliederung von Flüchtlingen in ihren Heimatländern oder Versöhnungsprogramme in vom Krieg zerrütteten Gemeinden.